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qpcr扩增的原理和步骤?

时间:2024-05-16 15:10|来源:未知|作者:admin|点击:0次

一、qpcr扩增的原理和步骤?

定量逆转录PCR(quantitative reverse transcription PCR, RT-qPCR)是应用于以RNA作为起始材料的PCR实验中的一种实验方法。在该方法中,总RNA或信使RNA(mRNA)首先通过逆转录酶转录成互补DNA(cDNA)。随后,以cDNA为模板进行qPCR反应。RT-qPCR已被用于多种分子生物学的应用中,其中包括基因表达分析、RNA干扰验证、微阵列验证、病原体检测、基因测试和疾病研究。

RT-qPCR的一步法与两步法

RT-qPCR可通过一步法或两步法来完成。一步法RT-qPCR把逆转录与PCR扩增结合在一起,使逆转录酶与DNA聚合酶在同一管内同样缓冲液条件下完成反应。一步法RT-qPCR只需要利用序列特异性引物。在两步法RT-qPCR中,逆转录和PCR扩增过程是在两个管中完成,使用不同的优化的缓冲液、反应条件、以及引物设计策略。

二、qpcr检测铁过载的原理?

将标记有荧光素的Taqman探针与模板DNA混合后,完成高温变性,低温复性,适温延伸的热循环,并遵守聚合酶链反应规律,与模板DNA互补配对的Taqman探针被切断,荧光素游离于反应体系中,在特定光激发下发出荧光,随着循环次数的增加,被扩增的目的基因片段呈指数规律增长,通过实时检测与之对应的随扩增而变化荧光信号强度,求得Ct值,同时利用数个已知模板浓度的标准品作对照,即可得出待测标本目的基因的拷贝数。

三、pcr和qpcr的原理和区别?

RT-PCR和一般的PCR相比原理上没有太多的区别,无非就是在反转时候RNA的定量,不同模板的设定。对引物没有特别的要求,能特异代表目的基因就行。

real-time PCR根据原理的不同,引物选择也不同。通常用的是SYBR Green的方法,这种方法引物在RT-PCR的基础上需要注意:

1.退火温度同内参;

2.片段长度不要超过200; real-time PCR的引物可以跑RT-PCR,反之不一定。

四、rt-qpcr与qpcr的区别?

虽然Real-time PCR(实时荧光定量PCR)和Reverse transcription PCR(反转录PCR)看

起来都可以缩写为RT-PCR,但是,国际上的约定俗成的是:RT-PCR

特指反转录PCR,而Real-time PCR一般缩写为qPCR(quantitative real-time PCR)。 更正楼主的观点:qPCR不一定与反转录相关,除了可以用cDNA作为模板,也可以用基因组DNA等作为模板。而反转录PCR也不一定非要与荧光定量相关,从mRNA中反转录得到cDNA,然后PCR扩增出目的基因,这也是反转录PCR。 综上,那RT-qPCR(也有人写成qRT-PCR)就很好理解了,就是结合了荧光定量技术的反转录PCR:先从RNA反转录得到cDNA(RT),然后用Real-time PCR进行定量分析(qPCR)。

五、qpcr技术的基本原理和过程?

基本原理:PCR技术的基本原理类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。DNA的半保留复制是生物进化和传代的重要途径。双链DNA在多种酶的作用下可以变性解旋成单链,在DNA聚合酶的参与下,根据碱基互补配对原则复制成同样的两分子拷贝。

在实验中发现,DNA在高温时也可以发生变性解链,当温度降低后又可以复性成为双链。因此,通过温度变化控制DNA的变性和复性,加入设计引物,DNA聚合酶、dNTP就可以完成特定基因的体外复制。

二、PCR由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成:

1、模板DNA的变性:模板DNA经加热至93℃左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备。

2、模板DNA与引物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降至55℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合。

3、引物的延伸:DNA模板--引物结合物在72℃、DNA聚合酶(如TaqDNA聚合酶)的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,按碱基互补配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板DNA链互补的半保留复制链。

六、qpcr 退火温度?

1、退火温度低于引物Tm值5 ℃左右,一般在45~55℃。退火温度需要从多方面去决定,一般根据引物的Tm值(Tm值=4(G+C) +2(A+T))为参考,根据扩增的长度适当下调作为退火温度。然后在此次实验基础上做出预估。退火温度对PCR的特异性有较大影响。

2、延伸时间:1min/kb(10kb内)。引物延伸一般在72℃进行(Taq酶最适温度)。但在扩增长度较短且退火温度较高时,本步骤可省略延伸时间随扩增片段长短而定,一般推荐在1000bp以上,含Pfu及其衍生物的衍生设定为1min/kbp。扩展资料PCR的过程:1、DNA变性:(90℃-96℃):双链DNA模板在热作用下,氢键断裂,形成单链DNA2、退火:(60℃-65℃):系统温度降低,引物与DNA模板结合,形成局部双链。

3、延伸:(70℃-75℃):在Taq酶(在72℃左右,活性最佳)的作用下,以dNTP为原料,从引物的3′端开始以从5′→3′端的方向延伸,合成与模板互补的DNA链。

七、rtpcr和qpcr区别?

RT-PCR是real-time PCR的话,和qPCR是一样的,都是荧光定量PCR。相比普通PCR,会加入染料,便于收集荧光信号。结果可以得出相对/绝对 浓度等多组数据,然后根据你的目的,对实际数据进行分析。还能通过ntc的ct值判断实验合不合格。

八、qpcr数值如何计算?

阈值= 基线(背景)信号标准偏差*10。(3-15个循环)。当荧光信号大于阈值时,可以肯定是由于PCR的扩增使得荧光强度得以测量。

九、qpcr如何设置阈值?

阈值最好取在直线上升的区域段,即呈对数增长的那一段,不然的话,信号不稳,而且Ct值也不准。 那条阈值的线可以拖动的,你自己调整一下。

(最后计算出来的结果和阈值的大小没有关系,所以你胆子大点,下手吧~)

十、qpcr标本怎么保存?

qpcr的标本一般都是dna,所以比较稳定,放在负20冰箱即可。

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