琼脂糖凝胶电泳是用琼脂糖作支持介质的一种电泳方法。其分析原理与其他支持物电泳的最主要区别是:它兼有“分子筛”和“电泳”的双重作用。 琼脂糖凝胶具有网络结构,物质分子通过时会受到阻力,大分子物质在涌动时受到的阻力大,因此在凝胶电泳中,带电颗粒的分离不仅取决于净电荷的性质和数量,而且还取决于分子大小,这就大大提高了分辨能力。但由于其孔径相当大,对大多数蛋白质来说其分子筛效应微不足道,现广泛应用于核酸的研究中。 DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时有电荷效应和分子筛效应。DNA分子在高于等电点的pH溶液中带负电荷,在电场中向正极移动。由于糖-磷酸骨架在结构上的重复性质,相同数量的双链DNA几乎具有等量的净电荷,因此它们能以同样的速率向正极方向移动。
二、实验原理
琼脂糖凝胶电泳是用于分离、鉴定和提纯DNA片段的标准方法。琼脂糖是从琼脂中提取的一种多糖,具亲水性,但不带电荷,是一种很好的电泳支持物。DNA在碱性条件下(pH8.0的缓冲液)带负电荷,在电场中通过凝胶介质向正极移动,不同DNA分子片段由于分子和构型不同,在电场中的泳动速率液不同。溴化乙锭(EB)可嵌入DNA分子碱基对间形成荧光络合物,经紫外线照射后,可分出不同的区带,达到分离、鉴定分子量,筛选重组子的目的
琼脂糖凝胶电泳是用琼脂糖作支持介质的一种电泳方法。其分析原理与其他支持物电泳最主要区别是:它兼有“分子筛”和“电泳”的双重作用。
琼脂糖凝胶具有网络结构,物质分子通过时会受到阻力,大分子物质在涌动时受到的阻力大,因此在凝胶电泳中,带电颗粒的分离不仅取决于净电荷的性质和数量,而且还取决于分子大小,这就大大提高了分辨能力。但由于其孔径相比于蛋白质太大,对大多数蛋白质来说其分子筛效应微不足道,现广泛应用于核酸的研究中。
电泳电压的设置,凝胶配置的比例,以及电泳时间等
RNA分子有很多二级结构,需经变性剂处理,而DNA一般不需要变性处理 RNA电泳的电泳槽及缓冲液均需要确保无RNAase,有RNAase抑制剂处理过;而DNA相应的则需要DNAase抑制剂处理 所用的缓冲液不同 染色过程不同
看你的质粒大小是多少,2kb一下,我是用1.5%-2%的跑25min,100V,2k以上的0.7%-1%的胶25-35min,100v-120v,具体你自己看情况了
DNA分子在琼脂糖凝胶中脉冲时有电荷效应和分子筛效应。DNA分子在高于等电点的ph溶液中带负电荷,在电场中向正极移动。由于糖-磷酸骨架在结构上的重复性质,相同数量的双链DNA几乎具有等量的净电荷,因此它们能以同样的速率向正极方向移动。
做RNA的琼脂糖凝胶电泳具体操作和步骤如下: 1.去离子甲酰胺。v电泳槽清洗:去污剂洗干净(一般浸泡过夜)水冲洗乙醇干燥-3%H2O2灌满室 温放置10分钟0.1%DEPC水冲洗
2.将制胶用具用70%乙醇中洗一遍,晾干备用
3.配制晾脂糖凝胶。
称0.5g琼脂糖,置干净的100ml锥形瓶中, 加入40ml蒸馏水,微波炉内加热使称脂糖彻底溶化均匀。
待胶凉至60-70 ℃,依次向其中加入9ml甲醛、5ml 10x MOPS缓冲液和0.5μl溴化乙锭,混合均匀。
灌制琼脂糖凝胶。
4.取DEPC处理过的500μl小离心管,依次加入如下试剂:10x MOPS爱冲液2μl,甲醛3.5μl,甲酰胺(去离子) 10μl, RNA样品4.5μl,混匀;上样;电泳:电泳槽内加入1XMOPS缓冲液,于7.5V/ml 的电压下电泳;电泳结束后,在紫外灯下检查结果。
扩展资料
琼脂糖凝胶电泳的分析原理与其他支持物电泳最主要区别是:它兼有“分子筛”和“电泳”的双重作用。
琼脂糖凝胶具有网络结构,物质分子通过时会受到阻力,大分子物质在涌动时受到的阻力大,因此在凝胶电泳中,带电颗粒的分离不仅取决于净电荷的性质和数量,而且还取决于分子大小,这就大大提高了分辨能力。但由于其孔径相比于蛋白质太大,对大多数蛋白质来说其分子筛效应微不足道,现广泛应用于核酸的研究中。
蛋白质和核酸会根据pH不同带有不同电荷,在电场中受力大小不同,因此跑的速度不同,根据这个原理可将其分开。电泳缓冲液的pH在6~9之间,离子强度0.02~0.05为最适。常用1%的琼脂糖作为电泳支持物。琼脂糖凝胶约可区分相差100bp的DNA片段,其分辨率虽比聚丙烯酰胺凝胶低,但它制备容易,分离范围广。普通琼脂糖凝胶分离DNA的范围为0.2-20kb,利用脉冲电泳,可分离高达10^7bp的DNA片段。
DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时有电荷效应和分子筛效应。DNA分子在高于等电点的pH溶液中带负电荷,在电场中向正极移动。由于糖-磷酸骨架在结构上的重复性质,相同数量的双链DNA几乎具有等量的净电荷,因此它们能以同样的速率向正极方向移动。
1.凝胶浓度高了容易起泡,尤其是劣质琼脂糖(浓度1-2%就可以)
2.如果要用高浓度的话,可以试试趁胶还热的时候,用小药勺之类的东西把起泡赶到边缘后挑起
3.刚加热完是有小气泡的,稍微静置一下,等气泡都消了,再倒进电泳槽
4.如果静置到有点凝固了还是有气泡的话,说明你加热的时间不够,没有完全融化
如果DNA出现降解或者是混有其他杂质,例如蛋白质、RNA的话,那么琼脂糖凝胶就能够检测得到DNA的质量。 标准主要是通过观察电泳条带的亮度,通过亮度就可以粗略地计算出DNA条带的含量。如果DNA出现损失,对应的条带就会变暗或者是消失。 线性的单一DNA样品一般是单条带,质粒的话可能会有2-3条带. 如果条带变宽、变暗、或者变成弥散的DNA条带,表示DNA非特异的降解. 如果条带变成多条,表示可能被酶切.如果质粒被单酶切,可能变成一条亮带. 如果有蛋白质污染,上样孔可能发亮.如果有RNA污染,可能小分子量部分会有弥散.
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